由于南京椴自然分布数量较少，所以南京椴的资源保护已迫在眉睫。南京椴种群数量减少主要源于环境的破坏和繁殖困难，其中人为干预是其种群数量和个体数目不断减少的主要原因。野外分布的南京椴常分布在山谷或者山凹处，沿溪流两侧生长。

南京椴面临濒危，资源保护势在必行。目前有效和快捷的方式是播种育苗，由于种资源有限，在加上椴树的胚后熟、坚硬的外壳，给南京椴的繁育带来了一定困难。不过好在大家对南京椴的认知度越来越高，研究的人员和力度逐渐加强，在不久的将来南京椴将成为园林绿化中的新秀。

抬头园林是最早批量化种播繁育南京椴的企业。从2013年开始,年育苗近百万。从2017年至2019年，抬头园林占据了椴树种苗市场的绝大部分市场份额，大大的提高了大家对椴树这一优秀苗木品种的认识，推动了椴树在苗圃市场的发展。

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